Постојат неколку различни дамки кои може да се користат за да се визуелизира и фотографира ДНК откако материјалот е одделен со гел електрофореза. Меѓу многуте избори, овие пет соеви се најчестиот почеток со Ethidium bromide, кој е најшироко користен. Кога работите со овој процес, важно е не само да ги знаете разликите меѓу соеви, туку и вродените здравствени ризици.
01 Етидиум бромид
Етидиум бромид е веројатно најпознатиот боја за визуелизација на ДНК. Оваа боја може да се користи во мешавината на гел, во електрофореза пуфер или да се нанесе бледо гел откако ќе се стартува. Молекулите на бојата се прилепуваат кон ДНК насоки и флуоресцираат под УВ светлина, покажувајќи ви точно каде се наоѓаат гените во гелот. И покрај нејзината предност, недостатокот е дека етидиум бромидот е потенцијален канцероген, па затоа мора да се постапува со голема грижа. Поради потенцијалните здравствени ризици при работа со овој гел, се пронајдени алтернативи. 02 SYBR Gold
SYBR златна боја може да се користи за дамки со двојна или еднонасочна ДНК или за да се нанесе РНК. SYBR Gold беше една од првите алтернативи на етидиум бромидот кој го погоди пазарот и се смета за посензитивен од етидиум бромид. Бојата покажува 1000 пати поголема УВ флуоресценција откако е врзана за нуклеинските киселини. Потоа продира дебели и високи проценти агарозни гелови и може да се користи во формалдехидните гелови. Бидејќи флуоресценцијата на неврзаната молекула е толку ниска, неоправданоста не е потребна. Молекуларните сонди имателот на лиценцата, исто така, (од лансирањето на SYBR Gold) развиваат и продаваат SYBR Safe и SYBR Green кои се побезбедни алтернативи на етидиум бромидот.
03 SYBR Green
Симболите Green I и II SYBR (повторно, продадени од молекуларни сонди) се оптимизирани за различни цели. Бидејќи тие се врзуваат за ДНК, тие сè уште се сметаат за потенцијални мутагени и поради тоа, тие треба да се ракуваат со внимание. SYBR Green I е почувствителен за употреба со двостран верижна ДНК, додека пак SYBR Green II, од друга страна, е најдобар за употреба со едноклеточна ДНК или РНК. Како и популарната боја на етидиум бромид, овие високо чувствителни дамки флуоресцираат под УВ светлина. 04 SYBR Safe
SYBR Safe беше дизајниран да биде побезбедна алтернатива на Ethidium Bromide и други дамки на SYBR. Не се смета за опасен отпад и обично може да се отстрани преку редовните системи за канализација (т.е. одредување на мозоци), бидејќи тестирањето на токсичност покажува дека не постои акутна токсичност. Тестирањето, исто така, покажува дека има мала или никаква генотоксичност на клетките на Сирискиот ханстер ембрион (SHE), човечки лимфоцити, клетки на глувци на глувци и во AMES-тестот. Дамката може да се користи со сини светлосни трансмилуминатори, што предизвикува помало оштетување на ДНК која се визуелизира и нуди подобра ефикасност за подоцнежното клонирање. 05 Ева Грин
Ева Грин е зелена флуоресцентна боја која е пронајдена да инхибира ПЦР во помала мера од другите бои. Ова го прави многу корисно за апликации како квантитативно PCR во реално време. Исто така е добар избор ако користите гелови со ниска топење за обновување на ДНК. Тој е многу стабилен на високи температури и има многу ниска флуоресценција на себе, но е многу флуоресцентен кога се врзува за ДНК. Ева Грин, исто така, е докажано дека има многу ниска или никаква цитотоксичност или мутагеност.